لم تكن القاهرة هي العاصمة الوحيدة لمصر على مر العصور , فقد تغيرت عاصمة مصر عدة مرات في تاريخها . 
و فيما يلي قائمة بعواصم المصرية مرتبة ترتيباً زمنياً: 

اون (الموقع الحالي عين شمس) (اصبحت عاصمة عام 4242ق.م) ـ أول عاصمة مصرية.

تانيس (صان الحجر) (قبل 2950 ق. م.) ـ ثاني عاصمة في التاريخ للوجهين القبلي والبحري.

منف (2950 ق. م. ـ 2180 ق. م.) ـ من الأسرة الأولى وحتى الأسرة الثامنة الفرعونية.

هيركليوبوليس (إهناسيا الحالية) (2180 ق.م. ـ 2060 ق. م.) ـ الأسرتان التاسعة والعاشرة الفرعونيتان.

طيبة (الأقصر الحالية) (2135 ق.م. ـ 1985 ق.م.) ـ الأسرة الحادية عشر.

أثيت تاوي ـ (1985 ق.م. ـ 1785 ق.م.) ـ الأسرة الثانية عشرة.

طيبة (1785 ق.م. ـ 1650 ق.م.) ـ الأسرة الثالثة عشرة.

خاسوت (سخا الحالية) (1715 ق. م. ـ 1650 ق. م.) ـ الأسرة الرابعة عشرة.

أواريس (زوان الحالية) (1650 ـ 1680 ق.م.) ـ الأسرة الخامسة عشرة (الهكسوس).

عاصمة الأسرة السادسة عشرة (التي كانت من الهكسوس أيضاً) مجهولة، ولكن ربما كانت في مملكة كوش.

طيبة (1650 ق.م. ـ 1353 ق.م.) ـ الأسرتان السابعة عشرة والأسرة الثامنة عشر (بعد إخناتون).

أخيتاتون ـ (تل العمارنة الحالية) (حوالي 1353 ـ حوالي 1332 ق.م.) ـ إخناتون (الأسرة الثامنة عشرة).

طيبة (1332 ق.م. ـ 1279 ق.م.) ـ الأسرتان الثامنة عشرة والتاسعة عشرة (قبل رمسيس الثاني).

بر ـ رعمسيس (1279 ـ 1078 ق. م.) ـ الأسرة التاسعة عشرة (بدءاً من رمسيس الثاني) والأسرة العشرون.

تانيس (صان الحجر الحالية) (1078 ـ 945 ق.م.) ـ الأسرة الحادية والعشرون.

بوباستيس (تل بسطة الحالية) (945 ـ 715 ق.م.) ـ الأسرة الثانية والعشرين.

تانيس (818 ـ 715 ق.م.) ـ الأسرة الثالثة والعشرون.

سايس (صان الحجر الحالية) (725 ـ 715 ق.م.) ـ الأسرة الرابعة والعشرون.

نباتا / منف (715 ـ 664 ق.م.) ـ كانت عاصمة الأسرة الخامسة والعشرية هي مدينة نباتا النوبية (لأن الأسرة 25 هي أسرة نوبية)، ولكنهم حكموا مصر من منف.

سايس (664 ـ 525 ق.م.) ـ الأسرة السادسة والعشرون.

فارسية - الأسرة السابعة والعشرون.

سايس (399 ـ 404 ق.م.) ـ الأسرة الثامنة والعشرون.

منديس (تل الربع الحالية) (399 ـ 380 ق.م.) ـ الأسرة التاسعة والعشرون.

سبينيتوس (سمنود الحالية) (380 ـ 343 ق.م.) ـ الأسرة الثلاثون.

فارسية - الأسرة الحادية والثلاثون.

الإسكندرية (332 ق.م. ـ 641 م).

الفسطاط (641 ـ 750).

العسكر (750 ـ 868).

القطائع (868 ـ 905).

الفسطاط (905 ـ 969).

القاهرة (969 - الآن).