الفيروسات التاجية هي مجموعة مسببة لأمراض بشرية وحيوانية. في نهاية عام 2019، تم تحديد فيروس تاجي جديد كسبب لمجموعة من حالات الالتهاب الرئوي في مدينة ووهان في مقاطعة هوبي الصينية. انتشر بسرعة، مما أدى إلى وباء في جميع أنحاء الصين، يليه عدد متزايد من الحالات في بلدان أخرى في جميع أنحاء العالم. في فبراير 2020، حددت منظمة الصحة العالمية المرض COVID-19، الذي يرمز إلى مرض فيروس التاجي 2019. تم تحديد الفيروس الذي يسبب COVID-19 المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة التاجية 2 (SARS-CoV-2) الذي تم سابقًا الإشارة إليه باسم 2019-nCoV.

أشار تسلسل الجينوم الكامل والتحليل النشوئي إلى أن الفيروس التاجي الذي يسبب COVID-19 هو فيروس بيتاكوروناف علي انه من نفس النوع الفرعي لفيروس المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (سارس) (بالإضافة إلى العديد من فيروسات الخفافيش التاجية)، ولكن في تسلسل مختلف. تشبه بنية منطقة الجين المرتبطة بالمستقبلات إلى حد كبير بنية الفيروس التاجي للسارس، وقد ثبت أن الفيروس يستخدم نفس المستقبل، الإنزيم المحول للأنجيوتنسين 2 (ACE2)، لدخول الخلية. اقترحت مجموعة دراسة الفيروسات التاجية التابعة للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات أن يتم تسمية هذا الفيروس بالتهاب الكبد التاجي الحاد 2 (SARS-CoV-2).

يبدو فيروس متلازمة الشرق الأوسط التنفسية (MERS)، وهو فيروس بيتاكورونافا، أكثر ارتباطًا به. أقرب تشابه في تسلسل الحمض النووي الريبي هو فيروسين كورونيين خفاشين، ويبدو من المرجح أن الخفافيش هي المصدر الأساسي؛ ما إذا كان فيروس COVID-19 ينتقل مباشرة من الخفافيش أو من خلال آلية أخرى (على سبيل المثال، من خلال مضيف وسيط) غير معروف.

في التحليل الوراثي لسلالات 103 سلالة من السارس CoV-2 من الصين، تم تحديد نوعين مختلفين من السارس CoV-2، النوع المعين L (يمثل 70 في المئة من السلالات) والنوع S (يمثل 30 في المئة). ساد النوع L خلال الأيام الأولى من الوباء في الصين، لكنه يمثل نسبة أقل من السلالات خارج ووهان مما كانت عليه في ووهان. الآثار السريرية لهذه النتائج غير مؤكدة.

على الصعيد العالمي، تم الإبلاغ عن أكثر من مليون وربعمائة وخمسون الف حالة مؤكدة من COVID-19. منذ التقارير الأولى عن حالات من ووهان، وهي مدينة في مقاطعة هوبي في الصين، في نهاية عام 2019، تم الإبلاغ عن أكثر من 80،000 حالة من COVID-19 في الصين، معظمها من هوبي والمقاطعات المحيطة بها. قدرت بعثة مشتركة بين منظمة الصحة العالمية (WHO) والصين لتقصي الحقائق أن الوباء في الصين بلغ ذروته بين أواخر يناير وأوائل فبراير 2020، وانخفض معدل الحالات الجديدة بشكل كبير بحلول أوائل مارس. ومع ذلك، تم الإبلاغ عن حالات في جميع القارات، باستثناء القارة القطبية الجنوبية، وكانت ترتفع باطراد في جميع أنحاء العالم.

فهم طرق النقل غير مكتمل. حدد التحقيق الوبائي في ووهان في بداية تفشي المرض وجود ارتباط أولي بسوق المأكولات البحرية الذي يبيع الحيوانات الحية، حيث عمل معظم المرضى أو زاروا، وأغلق بعد ذلك للتطهير. ومع ذلك، مع تقدم الفاشية، أصبح الانتشار من شخص لآخر هو الوسيلة الرئيسية لانتقال المرض.

يعتقد أن انتشار الفيروس التاجي الحاد 2 (SARS-CoV-2) من شخص لآخر عن طريق قطرات الجهاز التنفسي، يشبه انتشار الأنفلونزا. مع انتقال القطرات، يتم إطلاق الفيروس في إفرازات الجهاز التنفسي عندما يمكن للشخص المصاب بالعدوى السعال أو العطس أو المحادثة أن يصيب شخصًا آخر إذا كان على اتصال مباشر بالأغشية المخاطية؛ يمكن أن تحدث العدوى أيضًا إذا لمس الشخص سطحًا مصابًا ثم لمس عينيه أو أنفه أو فمه. عادة لا تسافر القطرات أكثر من ستة أقدام (حوالي مترين) ولا تتوقف في الهواء. على الرغم من ذلك وصفت دراسة ان الفيروس سارس - CoV - 2 طب قابلاً للتعلق في الهواء الجوي لمدة ثلاث ساعات على الأقل، فإن ملاءمة ذلك لوبائيات COVID-19 وآثاره السريرية غير واضحة. نظرًا لعدم اليقين الحالي فيما يتعلق بآليات الانتقال، يوصى بالاحتياطات من الفيروسات المحمولة جواً في مواقف معينة.

تم الكشف عن SARS-CoV-2 RNA في عينات الدم والبراز وتم زرع فيروس حي من البراز في بعض الحالات، ولكن وفقًا لتقرير مشترك بين منظمة الصحة العالمية والصين، فإن انتقال من البراز عن طريق الفم لا يبدو أنه عامل مهم في انتشار العدوى.

فترة العدوى وهي الفاصل الزمني الذي يكون فيه الشخص المصاب بـ COVID-19 معديًا غير مؤكد. معظم البيانات التي تبلغ عن هذه المشكلة هي من الدراسات التي تقيم الكشف عن الفيروس RNA من العينات التنفسية وغيرها. ومع ذلك، فإن الكشف عن الحمض النووي الريبي الفيروسي لا يشير بالضرورة إلى وجود فيروس معدي.

يبدو أن مستويات الحمض النووي الريبي الفيروسي من العينات التنفسية العليا أعلى بعد وقت قصير من ظهور الأعراض مقارنةً بالمرض اللاحق في المرض. بالإضافة إلى ذلك، في دراسة أجريت على مرضى يعانون من COVID-19 المعتدل، تم عزل الفيروس المعدي من عينات البلعوم والبلغم خلال الأسبوع الأول من المرض، ولكن ليس بعد هذه الفترة، على الرغم من استمرار ارتفاع مستويات الحمض النووي الريبي الفيروسي. تثير هذه النتائج احتمال أن يكون الانتقال أكثر احتمالا في المرحلة المبكرة من الإصابة، ولكن هناك حاجة إلى بيانات إضافية لتأكيد هذه الفرضية.

مدة القدرة علي نشر الفيروس متغيرة وقد تعتمد على شدة المرض. في إحدى الدراسات التي أجريت على 21 مريضًا يعانون من مرض خفيف (لا يوجد نقص في الأكسجين)، كرر 90 في المائة اختبارات الحمض النووي الريبي الفيروسي السلبية على المسحات البلعومية الأنفية قبل 10 أيام من ظهور الأعراض؛ كانت الاختبارات إيجابية لفترة أطول في المرضى الذين يعانون من مرض أكثر حدة. في دراسة أخرى لـ 137 مريضًا نجوا من COVID-19، كانت المدة المتوسطة لسفك الحمض النووي الريبي الفيروسي من العينات البلعومية 20 يومًا (تتراوح من 8 إلى 37 يومًا). لا يرتبط RNA الفيروسي القابل للكشف دائمًا بعزل الفيروس المعدي، وقد يكون هناك حد لمستوى RNA الفيروسي الذي من غير المحتمل أن تكون العدوى أقل. في دراسة تسعة مرضى يعانون من COVID-19 المعتدل لم يتم اكتشاف فيروس معدي من عينات الجهاز التنفسي عندما كان مستوى الحمض النووي الريبي الفيروسي <106 نسخة / مل.

تختلف المعدلات المبلغ عنها لانتقال العدوى من فرد مصاب بالعدوى حسب المكان وتدخلات مكافحة العدوى. وفقًا لتقرير مشترك لمنظمة الصحة العالمية والصين، تراوح معدل COVID-19 الثانوي من 1 إلى 5 بالمائة بين عشرات الآلاف من جهات الاتصال الوثيقة للمرضى المؤكدين في الصين. بينما بين أفراد الطاقم على متن سفينة سياحية، أصيب 2 في المائة بعدوى مؤكدة. في الولايات المتحدة، كان معدل الهجوم الثانوي من الأعراض 0.45 في المئة بين 445 اتصال قريب من 10 مرضى مؤكدين.

تم وصف انتقال السارس CoV - 2 من الأفراد بدون أعراض (أو الأفراد خلال فترة الحضانة) ومع ذلك، فإن مدى حدوث ذلك لا يزال غير معروف. في تحليل 157 حالة من نوع COVID-19 المكتسبة محليًا في سنغافورة، قُدِّر أن انتقال المرض خلال فترة الحضانة يمثل 6.4 في المائة؛ في مثل هذه الحالات، حدث التعرض قبل يوم إلى ثلاثة أيام من تطور الأعراض. قد يكون الفحص المصلي الواسع النطاق قادرًا على توفير إحساس أفضل بنطاق الالتهابات بدون أعراض وإبلاغ التحليل الوبائي؛ العديد من الاختبارات المصلية للسارس - CoV - 2 قيد التطوير، وواحد تمت الموافقة عليه من قبل إدارة الغذاء والدواء الأمريكية (FDA).